Međunarodni krivični sud za bivšu Jugoslaviju (MKSJ) osnovao je Vijeće sigurnosti Ujedinjenih naroda 1993. godine radi procesuiranja masovnih ubojstava i teških kršenja međunarodnog prava počinjenih tokom rata u Bosni. Ubrzo nakon uspostavljanja, sud je optužio predsjednika Republike Srpske Radovana Karadžića i zapovjednika vojske bosanskih Srba i Ratka Mladića za genocid u Srebrenici.
Karadžić i Mladić uhapšeni su trinaest, odnosno šesnaest godina kasnije, nakon što su se deceniju skrivali u Srbiji i RS-u. Prvobitnom presudom Karadžić oglašen je krivim za genocid u Srebrenici i osuđen na 40 godina zatvora, dok suđenje Mladiću još traje.
MKSJ je 2001. osudio generala Radislava Krstića za genocid i osudio ga na 46 godina zatvora (kazna koja je 2005. smanjena na 35 godina zatvora). Ovo je bila prva presuda Haškog tribunala za genocid.
U junu 2010. godine, bivši časnici Vojske RS-a Vujadin Popović i Ljubiša Beara osuđeni su na doživotnu kaznu zatvora zbog genocida nad Bošnjacima u Srebrenici, pored kazne još petorice pripadnika vojske i policije RS-a: Drago Nikolić (35 godina zatvora), Ljubomir Borovčanin (17 godina zatvora), Vinko Pandurević (13 godina zatvora), Radivoje Miletić (18 godina zatvora) i Milan Gvero (5 godina zatvora).
U prosincu 2012. godine Međunarodni krivični sud za bivšu Jugoslaviju osudio je generala Zdravka Tolimira, bivšeg pomoćnika Ratka Mladića i ratnog načelnika Obavještajne službe Vrhovne komande vojske RS-a proglašavajući ga krivim za genocid i osudivši ga na doživotnu robiju.
Za zločine u Srebrenici, Haški tribunal je osudio i bivše časnike Vojske RS-a Momira Nikolića na 20 godina zatvora, Vidoja Blagojevića (15 godina zatvora), Dragana Obrenovića (17 godina zatvora) i Dragana Jokića (9 godina zatvora). Sud Bosne i Hercegovine nastavio je sa procesuiranjem svojih podređenih, neposrednih izvršitelja zločina.
Presudom akcije Bosne i Hercegovine protiv tadašnje Savezne Republike Jugoslavije na Međunarodnom sudu pravde u Hagu (ICJ) dvanaest godina nakon zločina u Srebrenici, ICJ je također utvrdio da su, uz podršku Republike Srbije, "bosanski Srbi planirali i izvršio genocid u Srebrenici “.
